Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP9XQ93008 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
USP9XQ93008 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP9XQ93008 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP9XQ93008 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP9XQ93008 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP9XQ93008 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP9XQ93008 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP9XQ93008 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP9XQ93008 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP9XQ93008 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP9XQ93008 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP9XQ93008 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP9XQ93008 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP9XQ93008 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP9XQ93008 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP9XQ93008 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP9XQ93008 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP9XQ93008 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
USP9XQ93008 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP9XQ93008 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP9XQ93008 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP9XQ93008 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP9XQ93008 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP9XQ93008 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP9XQ93008 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP9XQ93008 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP9XQ93008 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP9XQ93008 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP9XQ93008 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP9XQ93008 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP9XQ93008 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP9XQ93008 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP9XQ93008 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP9XQ93008 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP9XQ93008 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP9XQ93008 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP9XQ93008 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP9XQ93008 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP9XQ93008 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP9XQ93008 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USP9XQ93008 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP9XQ93008 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP9XQ93008 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP9XQ93008 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP9XQ93008 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP9XQ93008 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP9XQ93008 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP9XQ93008 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP9XQ93008 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP9XQ93008 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP9XQ93008 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP9XQ93008 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP9XQ93008 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP9XQ93008 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms