Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPDL3BQ92485 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPDL3BQ92485 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMPDL3BQ92485 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPDL3BQ92485 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMPDL3BQ92485 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMPDL3BQ92485 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMPDL3BQ92485 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMPDL3BQ92485 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPDL3BQ92485 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMPDL3BQ92485 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPDL3BQ92485 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPDL3BQ92485 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPDL3BQ92485 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPDL3BQ92485 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPDL3BQ92485 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPDL3BQ92485 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPDL3BQ92485 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMPDL3BQ92485 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3BQ92485 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms