Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE7

TMEM170A, Transmembrane protein 170A, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170AQ8WVE7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM170AQ8WVE7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM170AQ8WVE7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM170AQ8WVE7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM170AQ8WVE7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM170AQ8WVE7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM170AQ8WVE7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM170AQ8WVE7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM170AQ8WVE7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM170AQ8WVE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM170AQ8WVE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM170AQ8WVE7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM170AQ8WVE7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM170AQ8WVE7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM170AQ8WVE7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM170AQ8WVE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM170AQ8WVE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM170AQ8WVE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM170AQ8WVE7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM170AQ8WVE7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM170AQ8WVE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms