Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD5

RNF141, RING finger protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF141Q8WVD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF141Q8WVD5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF141Q8WVD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF141Q8WVD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF141Q8WVD5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF141Q8WVD5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF141Q8WVD5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF141Q8WVD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF141Q8WVD5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF141Q8WVD5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF141Q8WVD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF141Q8WVD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF141Q8WVD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF141Q8WVD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF141Q8WVD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF141Q8WVD5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF141Q8WVD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF141Q8WVD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF141Q8WVD5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF141Q8WVD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF141Q8WVD5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RNF141Q8WVD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms