Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE62

CHDH, Choline dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHDHQ8NE62 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHDHQ8NE62 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHDHQ8NE62 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHDHQ8NE62 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHDHQ8NE62 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHDHQ8NE62 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHDHQ8NE62 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHDHQ8NE62 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHDHQ8NE62 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHDHQ8NE62 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHDHQ8NE62 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHDHQ8NE62 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHDHQ8NE62 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHDHQ8NE62 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHDHQ8NE62 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHDHQ8NE62 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHDHQ8NE62 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms