Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EID3Q8N140 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EID3Q8N140 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EID3Q8N140 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EID3Q8N140 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EID3Q8N140 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EID3Q8N140 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EID3Q8N140 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EID3Q8N140 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EID3Q8N140 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EID3Q8N140 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EID3Q8N140 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EID3Q8N140 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EID3Q8N140 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EID3Q8N140 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms