Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM9

SLC38A6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A6Q8IZM9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A6Q8IZM9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC38A6Q8IZM9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC38A6Q8IZM9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC38A6Q8IZM9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC38A6Q8IZM9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A6Q8IZM9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC38A6Q8IZM9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC38A6Q8IZM9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A6Q8IZM9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A6Q8IZM9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A6Q8IZM9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A6Q8IZM9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A6Q8IZM9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A6Q8IZM9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A6Q8IZM9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms