Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC105Q8IYK2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC105Q8IYK2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC105Q8IYK2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC105Q8IYK2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC105Q8IYK2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC105Q8IYK2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC105Q8IYK2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC105Q8IYK2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC105Q8IYK2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC105Q8IYK2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC105Q8IYK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC105Q8IYK2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC105Q8IYK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC105Q8IYK2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms