Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APLFQ8IW19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
APLFQ8IW19 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APLFQ8IW19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APLFQ8IW19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
APLFQ8IW19 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APLFQ8IW19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APLFQ8IW19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APLFQ8IW19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APLFQ8IW19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APLFQ8IW19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
APLFQ8IW19 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APLFQ8IW19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
APLFQ8IW19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APLFQ8IW19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APLFQ8IW19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APLFQ8IW19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APLFQ8IW19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
APLFQ8IW19 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
APLFQ8IW19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APLFQ8IW19 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APLFQ8IW19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APLFQ8IW19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
APLFQ8IW19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
APLFQ8IW19 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms