Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM17Q86X19 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM17Q86X19 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM17Q86X19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM17Q86X19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM17Q86X19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM17Q86X19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM17Q86X19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM17Q86X19 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM17Q86X19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM17Q86X19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM17Q86X19 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM17Q86X19 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM17Q86X19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM17Q86X19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM17Q86X19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM17Q86X19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM17Q86X19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM17Q86X19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms