Protein–RNA interactions for Protein: Q86X10

RALGAPB, Ral GTPase-activating protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPBQ86X10 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
RALGAPBQ86X10 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
RALGAPBQ86X10 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RALGAPBQ86X10 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
RALGAPBQ86X10 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RALGAPBQ86X10 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
RALGAPBQ86X10 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RALGAPBQ86X10 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.63■■■■□ 3.94
RALGAPBQ86X10 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
RALGAPBQ86X10 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RALGAPBQ86X10 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
RALGAPBQ86X10 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
RALGAPBQ86X10 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RALGAPBQ86X10 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
RALGAPBQ86X10 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
RALGAPBQ86X10 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
RALGAPBQ86X10 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RALGAPBQ86X10 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RALGAPBQ86X10 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
RALGAPBQ86X10 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RALGAPBQ86X10 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RALGAPBQ86X10 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RALGAPBQ86X10 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RALGAPBQ86X10 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
RALGAPBQ86X10 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RALGAPBQ86X10 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RALGAPBQ86X10 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RALGAPBQ86X10 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
RALGAPBQ86X10 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RALGAPBQ86X10 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RALGAPBQ86X10 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RALGAPBQ86X10 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RALGAPBQ86X10 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RALGAPBQ86X10 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
RALGAPBQ86X10 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
RALGAPBQ86X10 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RALGAPBQ86X10 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
RALGAPBQ86X10 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
RALGAPBQ86X10 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
RALGAPBQ86X10 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
RALGAPBQ86X10 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
RALGAPBQ86X10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RALGAPBQ86X10 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms