Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z794

KRT77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT77Q7Z794 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT77Q7Z794 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT77Q7Z794 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT77Q7Z794 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT77Q7Z794 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT77Q7Z794 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT77Q7Z794 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT77Q7Z794 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT77Q7Z794 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT77Q7Z794 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT77Q7Z794 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT77Q7Z794 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT77Q7Z794 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms