Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHFQ7M4L6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHFQ7M4L6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHFQ7M4L6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHFQ7M4L6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHFQ7M4L6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHFQ7M4L6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHFQ7M4L6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHFQ7M4L6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHFQ7M4L6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHFQ7M4L6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHFQ7M4L6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SHFQ7M4L6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHFQ7M4L6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHFQ7M4L6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SHFQ7M4L6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHFQ7M4L6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHFQ7M4L6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHFQ7M4L6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHFQ7M4L6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms