Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
LRRC9Q6ZRR7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
LRRC9Q6ZRR7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
LRRC9Q6ZRR7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.57■■■■■ 4.56
LRRC9Q6ZRR7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
LRRC9Q6ZRR7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
LRRC9Q6ZRR7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
LRRC9Q6ZRR7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
LRRC9Q6ZRR7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
LRRC9Q6ZRR7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
LRRC9Q6ZRR7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
LRRC9Q6ZRR7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
LRRC9Q6ZRR7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
LRRC9Q6ZRR7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
LRRC9Q6ZRR7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
LRRC9Q6ZRR7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
LRRC9Q6ZRR7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
LRRC9Q6ZRR7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
LRRC9Q6ZRR7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
LRRC9Q6ZRR7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
LRRC9Q6ZRR7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
LRRC9Q6ZRR7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
LRRC9Q6ZRR7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
LRRC9Q6ZRR7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
LRRC9Q6ZRR7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
LRRC9Q6ZRR7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
LRRC9Q6ZRR7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
LRRC9Q6ZRR7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
LRRC9Q6ZRR7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
LRRC9Q6ZRR7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
LRRC9Q6ZRR7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
LRRC9Q6ZRR7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
LRRC9Q6ZRR7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
LRRC9Q6ZRR7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
LRRC9Q6ZRR7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
LRRC9Q6ZRR7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
LRRC9Q6ZRR7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
LRRC9Q6ZRR7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
LRRC9Q6ZRR7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
LRRC9Q6ZRR7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
LRRC9Q6ZRR7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
LRRC9Q6ZRR7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
LRRC9Q6ZRR7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
LRRC9Q6ZRR7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
LRRC9Q6ZRR7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
LRRC9Q6ZRR7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.52■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
LRRC9Q6ZRR7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
LRRC9Q6ZRR7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
LRRC9Q6ZRR7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
LRRC9Q6ZRR7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms