Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK18

OGFOD3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3Q6PK18 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
OGFOD3Q6PK18 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OGFOD3Q6PK18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OGFOD3Q6PK18 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OGFOD3Q6PK18 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OGFOD3Q6PK18 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OGFOD3Q6PK18 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OGFOD3Q6PK18 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OGFOD3Q6PK18 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OGFOD3Q6PK18 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OGFOD3Q6PK18 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OGFOD3Q6PK18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27■■□□□ 1.91
OGFOD3Q6PK18 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
OGFOD3Q6PK18 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OGFOD3Q6PK18 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OGFOD3Q6PK18 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OGFOD3Q6PK18 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
OGFOD3Q6PK18 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
OGFOD3Q6PK18 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OGFOD3Q6PK18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OGFOD3Q6PK18 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OGFOD3Q6PK18 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
OGFOD3Q6PK18 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OGFOD3Q6PK18 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
OGFOD3Q6PK18 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OGFOD3Q6PK18 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OGFOD3Q6PK18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
OGFOD3Q6PK18 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
OGFOD3Q6PK18 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms