Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK5Q6P3R8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEK5Q6P3R8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEK5Q6P3R8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEK5Q6P3R8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEK5Q6P3R8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEK5Q6P3R8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEK5Q6P3R8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEK5Q6P3R8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEK5Q6P3R8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK5Q6P3R8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEK5Q6P3R8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NEK5Q6P3R8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NEK5Q6P3R8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEK5Q6P3R8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEK5Q6P3R8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEK5Q6P3R8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms