Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HCP5Q6MZN7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HCP5Q6MZN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HCP5Q6MZN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HCP5Q6MZN7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HCP5Q6MZN7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HCP5Q6MZN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCP5Q6MZN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCP5Q6MZN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCP5Q6MZN7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCP5Q6MZN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCP5Q6MZN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCP5Q6MZN7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HCP5Q6MZN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HCP5Q6MZN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms