Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MUC17Q685J3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MUC17Q685J3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC17Q685J3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MUC17Q685J3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MUC17Q685J3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MUC17Q685J3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MUC17Q685J3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC17Q685J3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MUC17Q685J3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MUC17Q685J3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC17Q685J3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MUC17Q685J3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC17Q685J3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MUC17Q685J3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MUC17Q685J3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MUC17Q685J3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC17Q685J3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MUC17Q685J3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MUC17Q685J3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MUC17Q685J3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
MUC17Q685J3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MUC17Q685J3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MUC17Q685J3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MUC17Q685J3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms