Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
EFCAB2Q5VUJ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
EFCAB2Q5VUJ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
EFCAB2Q5VUJ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
EFCAB2Q5VUJ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
EFCAB2Q5VUJ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
EFCAB2Q5VUJ9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
EFCAB2Q5VUJ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
EFCAB2Q5VUJ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
EFCAB2Q5VUJ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
EFCAB2Q5VUJ9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
EFCAB2Q5VUJ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
EFCAB2Q5VUJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
EFCAB2Q5VUJ9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
EFCAB2Q5VUJ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
EFCAB2Q5VUJ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
EFCAB2Q5VUJ9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
EFCAB2Q5VUJ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
EFCAB2Q5VUJ9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
EFCAB2Q5VUJ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
EFCAB2Q5VUJ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
EFCAB2Q5VUJ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
EFCAB2Q5VUJ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
EFCAB2Q5VUJ9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
EFCAB2Q5VUJ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
EFCAB2Q5VUJ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
EFCAB2Q5VUJ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
EFCAB2Q5VUJ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
EFCAB2Q5VUJ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
EFCAB2Q5VUJ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
EFCAB2Q5VUJ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
EFCAB2Q5VUJ9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
EFCAB2Q5VUJ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
EFCAB2Q5VUJ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.93■■■■■ 4.46
EFCAB2Q5VUJ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
EFCAB2Q5VUJ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
EFCAB2Q5VUJ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
EFCAB2Q5VUJ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.9■■■■■ 4.46
EFCAB2Q5VUJ9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
EFCAB2Q5VUJ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
EFCAB2Q5VUJ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
EFCAB2Q5VUJ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
EFCAB2Q5VUJ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
EFCAB2Q5VUJ9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
EFCAB2Q5VUJ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
EFCAB2Q5VUJ9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
EFCAB2Q5VUJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
EFCAB2Q5VUJ9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
EFCAB2Q5VUJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
EFCAB2Q5VUJ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
EFCAB2Q5VUJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
EFCAB2Q5VUJ9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
EFCAB2Q5VUJ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
EFCAB2Q5VUJ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
EFCAB2Q5VUJ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
EFCAB2Q5VUJ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
EFCAB2Q5VUJ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
EFCAB2Q5VUJ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
EFCAB2Q5VUJ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
EFCAB2Q5VUJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms