Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF20Q5VT98 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF20Q5VT98 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF20Q5VT98 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF20Q5VT98 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF20Q5VT98 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF20Q5VT98 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF20Q5VT98 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF20Q5VT98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF20Q5VT98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF20Q5VT98 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRAMEF20Q5VT98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF20Q5VT98 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF20Q5VT98 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF20Q5VT98 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms