Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYCP2LQ5T4T6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYCP2LQ5T4T6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYCP2LQ5T4T6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2LQ5T4T6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2LQ5T4T6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2LQ5T4T6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYCP2LQ5T4T6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYCP2LQ5T4T6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2LQ5T4T6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYCP2LQ5T4T6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SYCP2LQ5T4T6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYCP2LQ5T4T6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP2LQ5T4T6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms