Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
SAMD9Q5K651 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
SAMD9Q5K651 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SAMD9Q5K651 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SAMD9Q5K651 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SAMD9Q5K651 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SAMD9Q5K651 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SAMD9Q5K651 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SAMD9Q5K651 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
SAMD9Q5K651 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
SAMD9Q5K651 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SAMD9Q5K651 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
SAMD9Q5K651 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SAMD9Q5K651 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
SAMD9Q5K651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
SAMD9Q5K651 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SAMD9Q5K651 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
SAMD9Q5K651 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
SAMD9Q5K651 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
SAMD9Q5K651 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
SAMD9Q5K651 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
SAMD9Q5K651 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
SAMD9Q5K651 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
SAMD9Q5K651 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
SAMD9Q5K651 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.73■■■■■ 4.75
SAMD9Q5K651 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
SAMD9Q5K651 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
SAMD9Q5K651 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
SAMD9Q5K651 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
SAMD9Q5K651 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
SAMD9Q5K651 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SAMD9Q5K651 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
SAMD9Q5K651 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.57■■■■■ 4.73
SAMD9Q5K651 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
SAMD9Q5K651 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SAMD9Q5K651 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SAMD9Q5K651 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
SAMD9Q5K651 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SAMD9Q5K651 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
SAMD9Q5K651 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SAMD9Q5K651 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SAMD9Q5K651 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
SAMD9Q5K651 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
SAMD9Q5K651 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
SAMD9Q5K651 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
SAMD9Q5K651 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SAMD9Q5K651 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
SAMD9Q5K651 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
SAMD9Q5K651 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
SAMD9Q5K651 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SAMD9Q5K651 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.02■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SAMD9Q5K651 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SAMD9Q5K651 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 628.7 ms