Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRB2Q5IJ48 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB2Q5IJ48 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRB2Q5IJ48 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRB2Q5IJ48 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CRB2Q5IJ48 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CRB2Q5IJ48 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CRB2Q5IJ48 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRB2Q5IJ48 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB2Q5IJ48 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CRB2Q5IJ48 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CRB2Q5IJ48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CRB2Q5IJ48 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms