Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N7

FAM229B, Protein FAM229B, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM229BQ4G0N7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM229BQ4G0N7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM229BQ4G0N7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAM229BQ4G0N7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM229BQ4G0N7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM229BQ4G0N7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM229BQ4G0N7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAM229BQ4G0N7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms