Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LAMA3Q16787 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LAMA3Q16787 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LAMA3Q16787 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
LAMA3Q16787 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LAMA3Q16787 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA3Q16787 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LAMA3Q16787 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMA3Q16787 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMA3Q16787 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
LAMA3Q16787 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LAMA3Q16787 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LAMA3Q16787 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LAMA3Q16787 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LAMA3Q16787 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LAMA3Q16787 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LAMA3Q16787 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA3Q16787 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LAMA3Q16787 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LAMA3Q16787 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LAMA3Q16787 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LAMA3Q16787 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LAMA3Q16787 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMA3Q16787 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LAMA3Q16787 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LAMA3Q16787 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LAMA3Q16787 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LAMA3Q16787 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LAMA3Q16787 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
LAMA3Q16787 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMA3Q16787 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
LAMA3Q16787 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMA3Q16787 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LAMA3Q16787 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LAMA3Q16787 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LAMA3Q16787 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LAMA3Q16787 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LAMA3Q16787 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LAMA3Q16787 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMA3Q16787 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LAMA3Q16787 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMA3Q16787 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LAMA3Q16787 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms