Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNXAQ16473 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNXAQ16473 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TNXAQ16473 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNXAQ16473 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNXAQ16473 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNXAQ16473 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNXAQ16473 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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