Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF11Q15544 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TAF11Q15544 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TAF11Q15544 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TAF11Q15544 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TAF11Q15544 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TAF11Q15544 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TAF11Q15544 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TAF11Q15544 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF11Q15544 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF11Q15544 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF11Q15544 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.9 ms