Protein–RNA interactions for Protein: Q15047

SETDB1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETDB1Q15047 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SETDB1Q15047 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SETDB1Q15047 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETDB1Q15047 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETDB1Q15047 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SETDB1Q15047 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETDB1Q15047 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETDB1Q15047 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SETDB1Q15047 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SETDB1Q15047 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETDB1Q15047 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SETDB1Q15047 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SETDB1Q15047 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETDB1Q15047 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETDB1Q15047 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SETDB1Q15047 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETDB1Q15047 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms