Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SHPRHQ149N8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SHPRHQ149N8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SHPRHQ149N8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SHPRHQ149N8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SHPRHQ149N8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
SHPRHQ149N8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SHPRHQ149N8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SHPRHQ149N8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHPRHQ149N8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
SHPRHQ149N8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHPRHQ149N8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
SHPRHQ149N8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SHPRHQ149N8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SHPRHQ149N8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SHPRHQ149N8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SHPRHQ149N8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SHPRHQ149N8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
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