Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMCO1Q147U7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMCO1Q147U7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMCO1Q147U7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMCO1Q147U7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMCO1Q147U7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMCO1Q147U7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMCO1Q147U7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMCO1Q147U7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMCO1Q147U7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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