Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
CBX2Q14781 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CBX2Q14781 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CBX2Q14781 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CBX2Q14781 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CBX2Q14781 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CBX2Q14781 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CBX2Q14781 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CBX2Q14781 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CBX2Q14781 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CBX2Q14781 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CBX2Q14781 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CBX2Q14781 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CBX2Q14781 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CBX2Q14781 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CBX2Q14781 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CBX2Q14781 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CBX2Q14781 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CBX2Q14781 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms