Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL9A2Q14055 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL9A2Q14055 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL9A2Q14055 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL9A2Q14055 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COL9A2Q14055 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL9A2Q14055 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL9A2Q14055 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL9A2Q14055 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COL9A2Q14055 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL9A2Q14055 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL9A2Q14055 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL9A2Q14055 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
COL9A2Q14055 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COL9A2Q14055 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL9A2Q14055 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL9A2Q14055 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
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