Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CKAP5Q14008 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKAP5Q14008 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKAP5Q14008 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKAP5Q14008 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKAP5Q14008 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CKAP5Q14008 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CKAP5Q14008 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CKAP5Q14008 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKAP5Q14008 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CKAP5Q14008 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CKAP5Q14008 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CKAP5Q14008 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKAP5Q14008 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CKAP5Q14008 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CKAP5Q14008 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CKAP5Q14008 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CKAP5Q14008 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CKAP5Q14008 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP5Q14008 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CKAP5Q14008 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP5Q14008 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CKAP5Q14008 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CKAP5Q14008 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CKAP5Q14008 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP5Q14008 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CKAP5Q14008 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CKAP5Q14008 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CKAP5Q14008 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CKAP5Q14008 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CKAP5Q14008 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CKAP5Q14008 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP5Q14008 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP5Q14008 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKAP5Q14008 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKAP5Q14008 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP5Q14008 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
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