Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC2Q13868 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC2Q13868 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC2Q13868 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC2Q13868 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC2Q13868 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC2Q13868 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXOSC2Q13868 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXOSC2Q13868 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXOSC2Q13868 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC2Q13868 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXOSC2Q13868 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC2Q13868 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXOSC2Q13868 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC2Q13868 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC2Q13868 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC2Q13868 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
EXOSC2Q13868 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC2Q13868 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC2Q13868 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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