Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PKP1Q13835 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PKP1Q13835 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PKP1Q13835 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PKP1Q13835 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PKP1Q13835 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PKP1Q13835 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PKP1Q13835 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PKP1Q13835 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PKP1Q13835 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PKP1Q13835 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PKP1Q13835 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PKP1Q13835 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PKP1Q13835 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PKP1Q13835 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PKP1Q13835 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PKP1Q13835 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKP1Q13835 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKP1Q13835 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PKP1Q13835 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKP1Q13835 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PKP1Q13835 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PKP1Q13835 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PKP1Q13835 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PKP1Q13835 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PKP1Q13835 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PKP1Q13835 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PKP1Q13835 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PKP1Q13835 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PKP1Q13835 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PKP1Q13835 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
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