Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNAPC2Q13487 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SNAPC2Q13487 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SNAPC2Q13487 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SNAPC2Q13487 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SNAPC2Q13487 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SNAPC2Q13487 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SNAPC2Q13487 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SNAPC2Q13487 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNAPC2Q13487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SNAPC2Q13487 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SNAPC2Q13487 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
SNAPC2Q13487 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SNAPC2Q13487 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SNAPC2Q13487 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SNAPC2Q13487 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SNAPC2Q13487 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SNAPC2Q13487 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SNAPC2Q13487 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SNAPC2Q13487 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SNAPC2Q13487 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SNAPC2Q13487 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SNAPC2Q13487 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SNAPC2Q13487 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNAPC2Q13487 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SNAPC2Q13487 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
SNAPC2Q13487 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SNAPC2Q13487 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNAPC2Q13487 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNAPC2Q13487 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SNAPC2Q13487 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SNAPC2Q13487 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SNAPC2Q13487 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SNAPC2Q13487 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
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