Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC49.25■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.24■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC49.22■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC49.21■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.21■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC49.2■■■■■ 5.47
PRDM2Q13029 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
PRDM2Q13029 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC49.16■■■■■ 5.46
PRDM2Q13029 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
PRDM2Q13029 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
PRDM2Q13029 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC49.07■■■■■ 5.45
PRDM2Q13029 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC49.03■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC49.03■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.02■■■■■ 5.44
PRDM2Q13029 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC48.95■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
PRDM2Q13029 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.91■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC48.91■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.89■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC48.89■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
PRDM2Q13029 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC48.88■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.86■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC48.86■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC48.85■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC48.84■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC48.83■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
PRDM2Q13029 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
PRDM2Q13029 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC48.78■■■■■ 5.4
PRDM2Q13029 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.73■■■■■ 5.39
PRDM2Q13029 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
PRDM2Q13029 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
PRDM2Q13029 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC48.68■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC48.67■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC48.66■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
PRDM2Q13029 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC48.61■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC48.59■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
PRDM2Q13029 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PRDM2Q13029 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
PRDM2Q13029 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC48.46■■■■■ 5.35
PRDM2Q13029 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
PRDM2Q13029 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC48.43■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC48.42■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC48.4■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC48.39■■■■■ 5.34
PRDM2Q13029 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
PRDM2Q13029 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
PRDM2Q13029 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC48.3■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
PRDM2Q13029 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.25■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.25■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC48.24■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC48.21■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
PRDM2Q13029 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC48.09■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
PRDM2Q13029 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC48.01■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
PRDM2Q13029 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC47.95■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.27
PRDM2Q13029 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms