Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CPSF1Q10570 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CPSF1Q10570 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CPSF1Q10570 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CPSF1Q10570 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CPSF1Q10570 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CPSF1Q10570 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CPSF1Q10570 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CPSF1Q10570 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CPSF1Q10570 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CPSF1Q10570 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPSF1Q10570 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CPSF1Q10570 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CPSF1Q10570 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CPSF1Q10570 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CPSF1Q10570 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CPSF1Q10570 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CPSF1Q10570 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CPSF1Q10570 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CPSF1Q10570 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CPSF1Q10570 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CPSF1Q10570 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CPSF1Q10570 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CPSF1Q10570 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CPSF1Q10570 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CPSF1Q10570 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CPSF1Q10570 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CPSF1Q10570 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CPSF1Q10570 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
CPSF1Q10570 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CPSF1Q10570 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CPSF1Q10570 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CPSF1Q10570 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CPSF1Q10570 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CPSF1Q10570 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
CPSF1Q10570 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CPSF1Q10570 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CPSF1Q10570 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CPSF1Q10570 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CPSF1Q10570 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CPSF1Q10570 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CPSF1Q10570 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CPSF1Q10570 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CPSF1Q10570 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CPSF1Q10570 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
CPSF1Q10570 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CPSF1Q10570 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CPSF1Q10570 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CPSF1Q10570 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CPSF1Q10570 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CPSF1Q10570 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
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