Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMAGPQ0VAQ4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAGPQ0VAQ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SMAGPQ0VAQ4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SMAGPQ0VAQ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SMAGPQ0VAQ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMAGPQ0VAQ4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMAGPQ0VAQ4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms