Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
ABCC8Q09428 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC48.77■■■■■ 5.4
ABCC8Q09428 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
ABCC8Q09428 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC48.68■■■■■ 5.38
ABCC8Q09428 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
ABCC8Q09428 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC48.67■■■■■ 5.38
ABCC8Q09428 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
ABCC8Q09428 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
ABCC8Q09428 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
ABCC8Q09428 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
ABCC8Q09428 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC8Q09428 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.52■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
ABCC8Q09428 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.35
ABCC8Q09428 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
ABCC8Q09428 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC48.47■■■■■ 5.35
ABCC8Q09428 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.46■■■■■ 5.35
ABCC8Q09428 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCC8Q09428 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
ABCC8Q09428 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC48.42■■■■■ 5.34
ABCC8Q09428 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCC8Q09428 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
ABCC8Q09428 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC48.38■■■■■ 5.33
ABCC8Q09428 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC48.34■■■■■ 5.33
ABCC8Q09428 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC48.34■■■■■ 5.33
ABCC8Q09428 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC48.32■■■■■ 5.33
ABCC8Q09428 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCC8Q09428 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
ABCC8Q09428 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
ABCC8Q09428 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
ABCC8Q09428 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.2■■■■■ 5.31
ABCC8Q09428 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
ABCC8Q09428 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.29
ABCC8Q09428 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
ABCC8Q09428 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
ABCC8Q09428 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
ABCC8Q09428 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC48.03■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC48.01■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC48.01■■■■■ 5.28
ABCC8Q09428 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC48■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
ABCC8Q09428 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC47.89■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
ABCC8Q09428 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.85■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
ABCC8Q09428 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ABCC8Q09428 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.8■■■■■ 5.24
ABCC8Q09428 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
ABCC8Q09428 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
ABCC8Q09428 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
ABCC8Q09428 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
ABCC8Q09428 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC8Q09428 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC8Q09428 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
ABCC8Q09428 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.68■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ABCC8Q09428 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
ABCC8Q09428 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms