Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF4Q08170 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRSF4Q08170 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRSF4Q08170 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRSF4Q08170 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF4Q08170 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRSF4Q08170 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SRSF4Q08170 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF4Q08170 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF4Q08170 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms