Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRTAP1-1Q07627 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP1-1Q07627 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRTAP1-1Q07627 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP1-1Q07627 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRTAP1-1Q07627 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRTAP1-1Q07627 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP1-1Q07627 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRTAP1-1Q07627 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRTAP1-1Q07627 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRTAP1-1Q07627 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP1-1Q07627 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP1-1Q07627 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRTAP1-1Q07627 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP1-1Q07627 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRTAP1-1Q07627 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms