Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RAD51Q06609 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD51Q06609 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RAD51Q06609 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD51Q06609 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAD51Q06609 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAD51Q06609 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAD51Q06609 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAD51Q06609 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD51Q06609 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RAD51Q06609 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAD51Q06609 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAD51Q06609 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAD51Q06609 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD51Q06609 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD51Q06609 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD51Q06609 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD51Q06609 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD51Q06609 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD51Q06609 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD51Q06609 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD51Q06609 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD51Q06609 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD51Q06609 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAD51Q06609 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAD51Q06609 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms