Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KRT17Q04695 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KRT17Q04695 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KRT17Q04695 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
KRT17Q04695 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT17Q04695 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KRT17Q04695 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT17Q04695 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KRT17Q04695 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KRT17Q04695 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KRT17Q04695 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
KRT17Q04695 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KRT17Q04695 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KRT17Q04695 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT17Q04695 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KRT17Q04695 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
KRT17Q04695 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
KRT17Q04695 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KRT17Q04695 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KRT17Q04695 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KRT17Q04695 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KRT17Q04695 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT17Q04695 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT17Q04695 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms