Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHLH1Q02575 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NHLH1Q02575 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NHLH1Q02575 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NHLH1Q02575 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NHLH1Q02575 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NHLH1Q02575 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHLH1Q02575 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHLH1Q02575 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHLH1Q02575 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NHLH1Q02575 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NHLH1Q02575 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NHLH1Q02575 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NHLH1Q02575 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHLH1Q02575 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHLH1Q02575 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NHLH1Q02575 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NHLH1Q02575 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NHLH1Q02575 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NHLH1Q02575 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NHLH1Q02575 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NHLH1Q02575 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NHLH1Q02575 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NHLH1Q02575 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NHLH1Q02575 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NHLH1Q02575 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NHLH1Q02575 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NHLH1Q02575 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NHLH1Q02575 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHLH1Q02575 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NHLH1Q02575 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NHLH1Q02575 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NHLH1Q02575 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms