Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
XPCQ01831 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
XPCQ01831 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
XPCQ01831 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
XPCQ01831 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
XPCQ01831 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
XPCQ01831 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
XPCQ01831 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
XPCQ01831 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
XPCQ01831 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
XPCQ01831 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
XPCQ01831 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
XPCQ01831 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
XPCQ01831 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
XPCQ01831 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.97■■■■□ 3.83
XPCQ01831 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
XPCQ01831 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
XPCQ01831 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
XPCQ01831 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
XPCQ01831 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
XPCQ01831 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
XPCQ01831 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
XPCQ01831 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
XPCQ01831 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
XPCQ01831 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
XPCQ01831 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
XPCQ01831 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
XPCQ01831 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
XPCQ01831 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
XPCQ01831 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
XPCQ01831 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
XPCQ01831 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
XPCQ01831 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
XPCQ01831 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
XPCQ01831 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
XPCQ01831 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
XPCQ01831 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
XPCQ01831 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
XPCQ01831 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
XPCQ01831 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
XPCQ01831 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
XPCQ01831 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
XPCQ01831 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
XPCQ01831 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
XPCQ01831 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
XPCQ01831 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
XPCQ01831 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
XPCQ01831 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
XPCQ01831 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
XPCQ01831 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
XPCQ01831 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
XPCQ01831 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
XPCQ01831 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
XPCQ01831 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
XPCQ01831 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
XPCQ01831 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
XPCQ01831 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
XPCQ01831 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
XPCQ01831 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
XPCQ01831 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
XPCQ01831 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
XPCQ01831 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
XPCQ01831 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
XPCQ01831 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
XPCQ01831 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
XPCQ01831 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
XPCQ01831 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
XPCQ01831 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
XPCQ01831 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
XPCQ01831 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
XPCQ01831 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
XPCQ01831 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
XPCQ01831 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.3■■■■□ 3.72
XPCQ01831 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
XPCQ01831 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
XPCQ01831 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
XPCQ01831 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
XPCQ01831 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
XPCQ01831 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
XPCQ01831 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
XPCQ01831 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
XPCQ01831 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
XPCQ01831 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
XPCQ01831 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
XPCQ01831 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
XPCQ01831 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
XPCQ01831 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
XPCQ01831 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
XPCQ01831 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
XPCQ01831 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
XPCQ01831 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
XPCQ01831 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
XPCQ01831 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
XPCQ01831 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
XPCQ01831 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
XPCQ01831 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
XPCQ01831 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
XPCQ01831 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
XPCQ01831 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
XPCQ01831 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms