Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE1BQ01064 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE1BQ01064 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE1BQ01064 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE1BQ01064 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE1BQ01064 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE1BQ01064 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE1BQ01064 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE1BQ01064 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE1BQ01064 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE1BQ01064 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE1BQ01064 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE1BQ01064 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE1BQ01064 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE1BQ01064 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE1BQ01064 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE1BQ01064 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE1BQ01064 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PDE1BQ01064 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms