Protein–RNA interactions for Protein: P62312

LSM6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM6P62312 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSM6P62312 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM6P62312 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSM6P62312 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LSM6P62312 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM6P62312 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM6P62312 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM6P62312 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSM6P62312 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSM6P62312 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSM6P62312 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSM6P62312 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSM6P62312 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM6P62312 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSM6P62312 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSM6P62312 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM6P62312 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM6P62312 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM6P62312 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM6P62312 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSM6P62312 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM6P62312 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSM6P62312 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSM6P62312 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM6P62312 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM6P62312 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM6P62312 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM6P62312 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM6P62312 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM6P62312 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSM6P62312 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM6P62312 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM6P62312 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM6P62312 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM6P62312 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSM6P62312 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM6P62312 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM6P62312 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM6P62312 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM6P62312 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM6P62312 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM6P62312 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM6P62312 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM6P62312 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM6P62312 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM6P62312 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM6P62312 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM6P62312 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM6P62312 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM6P62312 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM6P62312 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM6P62312 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM6P62312 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM6P62312 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM6P62312 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM6P62312 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM6P62312 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM6P62312 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM6P62312 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSM6P62312 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM6P62312 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSM6P62312 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM6P62312 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM6P62312 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM6P62312 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM6P62312 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM6P62312 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM6P62312 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM6P62312 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM6P62312 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM6P62312 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM6P62312 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM6P62312 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM6P62312 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM6P62312 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM6P62312 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM6P62312 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM6P62312 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM6P62312 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM6P62312 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM6P62312 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM6P62312 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM6P62312 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM6P62312 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM6P62312 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM6P62312 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM6P62312 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM6P62312 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM6P62312 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM6P62312 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM6P62312 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM6P62312 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM6P62312 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM6P62312 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM6P62312 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM6P62312 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM6P62312 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM6P62312 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM6P62312 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM6P62312 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms