Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPZ1P61923 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPZ1P61923 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COPZ1P61923 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPZ1P61923 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COPZ1P61923 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPZ1P61923 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPZ1P61923 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPZ1P61923 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPZ1P61923 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms