Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00313P59037 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00313P59037 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00313P59037 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00313P59037 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00313P59037 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00313P59037 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00313P59037 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00313P59037 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms